NCBI []
NCBI (National Center for Biotechnology Information）是就是指美国国立生物新科技资讯当中心
EMBL []
欧洲分子生物学试验中室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）
DDBJ []
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建立，是世界性并列DNA 文档之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI文档共同都由国际DNA文档
CNGB []
当中国东欧国家文档（China National GeneBank）设于深圳白沙最初区，是一举成名世界性并列文档之后的全世界第四大东欧国家级文档。它是当中国首个，也是唯一一个东欧国家DNA库，相较全世界另外三个DNA库而言，东欧国家DNA库样品留存的为数、存储量和可到访的数据量皆是全世界最大。
BIGD []
当中国东欧国家DNA组科学数据当中心 生命与健康大数据当中心 (National Genomics Data Center BIG Data Center)
2、非编码RNA文档（1）.非编码小RNA文档miRBase []
piRNAbank []
piRNAbank []
SILVA []
（2）.长非编码RNA文档：LncRNAdb []
原核生物
LncRNAwiki [_Page]
本能长非编码RNA文档
（3）.非编码RNA远亲文档Rfam[]
相似Pfam的RNA远亲释义文档
（4）.非编码RNA核苷酸文档RNAcentral [ ]3、胺基酸文档（1）.胺基酸资讯Human protein atlas [ ]
人体细胞在细胞、组织、生理条件下的隐含
（2）.细胞核苷酸文档Pfam []
Pfam是胺基酸远亲的文档，包括适用隐马尔可夫模型生成的释义和多核苷酸分析。
SwissProt []
手动释义的非缓冲器细胞核苷酸文档
UniProt [ ]
PIR []
Antibodies []
BRENDA [ ]
HPRD []
InterPro []
通过整合多个细胞系统性文档，提供了一个简便的对细胞核苷酸顺利进行系统释义的平台，包括对胺基酸远亲、骨架域、系统亚基的预报
iProClass []
PRF []
REBASE []
（3）.胺基酸骨架文档PDB []
通过试验中测应在的骨架
SCOP []
CATH []
PSI []
（4）.细胞组文档PRIDE []（5）.胺基酸系统域文档PROSITE []
最下半年
Pfam []
最大学本科
ProDom []
CCD []
Prints []
SMART [ ]
TIGRFAM []
（6）.细胞互作文档STRING []
DIP []
试验中验证的细胞基本粒子文档
BioGRID [] ：
IntAct [ ]
4、人体内文档MapMan：一个系统强大的人体内途径详细资讯和编辑软件
（1）.人体内途径文档KEGG []
GO []
NCBI BioSystems []
IMP []
plantCyc []
MANET [ ]
MetaNetX [ ]
（2）.人体内组学；也用文档MataboLights []
HMDB []
YMDB []
ECMDB []
（3）.表型文档Planteome []
dbGaP []
IPPN []
5、核苷酸分析（1）.核苷酸与文档分析Blast []（2）.多核苷酸时有分析Clustal（3）.核苷酸进化树量化MEGA6、DNA量化（1）.DNA资讯GeneCard []
Gene Wiki[_Wiki ]
（2）.DNA释义Blast []
Interproscan []，
WEGO []
KAAS []
（3）.DNA系统预报：FGENESH []
AUGUSTUS [ ]
GENESCAN []
GeneMark []
Glimmer []
（4）.DNA骨架预报Exon-Intron Graphic Maker []
根据候选DNA的位点和内含子等资讯绘成DNA骨架
Blastp [_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome]
可离线利用细胞骨架域的释义和前方资讯
（5）.相似性DNA量化OrthoDB是直系相似性物的综合目录[]（6）.亚细胞应在位预报PSORT Prediction []（7）.位点量化Plantcare []（8）.调控目的DNA的miRNA预报psRNAtarget []（9）.隐含量化ArrayExpress [ ]
数据来自EMBL的生物医学系统DNA组学试验中的数据；
BAR []
在量化DNA系统时，通；也会参考DNA的隐含方式而，即DNA在木本植物不同组织不同生殖时期的隐含丰度转变。通过离线量化网站BAR对候DNA顺利进行隐含量化。 是一个木本植物生信量化自然资源网站，用该网站量化DNA隐含时，不仅可以获得DNA隐含方式而的热图，还可以获得可视化的电子白光图片，直观呈现DNA在木本植物组织当中的隐含前方。
（10）.DNA骨架绘成GSDS []
Gene Structure Display Server，基于DNA组释义文件绘成核苷酸DNA骨架等系统
7、胺基酸量化（1）.细胞二级三级骨架预报及绘图CFSSP []SOPMA [_automat.pl?page=npsa_sopma.html]PredictProtein []SWISS-MODEL []（2）.细胞功能性量化ProtParam []
细胞功能性量化是就是指细胞的一些宇宙学和化学变量，如分子量、等电点、核苷酸和原子都由、消光系数、半衰、不稳应在系数、脂肪酸族人核苷酸就是指数、亲常。这些变量，更容易顺利进行细胞的系统性生化试验中。比如在体外法制（大肠杆菌、酵母菌等）隐含和分离目的细胞时，需要顾虑细胞的分子量、等电点、消光系数、不稳应在系数和亲常等。在酶活试验中当中，也需要根据这些变量优化试验中法制。
（3）.细胞有别常量化Protscale []
细胞核苷酸的有别常主要由其侧链基团R，如果R只是H或是C、H两金属元素都由的话，都是游离的，如果成份分子会侧链基团，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是分子会的（亲水的）。游离性核苷酸有酪氨酸、色氨酸、苯乙酰、缬氨酸、赖氨酸、异赖氨酸、乙酰和糖类（甲硫氨酸）。游离性核苷酸在胺基酸内部，在保持胺基酸的三级骨架上，酶和基质、抗体和蛋白质时有的基本粒子等各种非配位的分子相结合方面，有着极为重要起着。
（4）.跨管壁骨架量化TMHMM []
细胞的跨管壁骨架量化对于预报细胞的亚细胞应在位密切系统性。如果有着跨管壁骨架，细胞很可能会应在设于细胞当中与管壁系统性的骨架，如基质管壁、细胞器管壁或肝细胞管壁等内管壁系统。此外，细胞跨管壁骨架量化对于细胞系统量化也有一应在的帮助。比如某细胞没有跨管壁骨架，但是亚细胞应在位试验中显示其可应在设于管壁系统性骨架，这明确就是指出该细胞可能会通过其他管壁应在位细胞召募过去的。
（5）.瞬时肽量化SignalP []
山麓瞬时前方为瞬时肽切割点，山麓之前的核苷酸为瞬时肽
瞬时肽是就是指引领最初小分子的胺基酸向新陈代谢通路移转到的粗壮多肽，；也设于细胞的N-两端，负责把胺基酸引领到不同管壁骨架的亚细胞器内。编码新陈代谢细胞的mRNA在翻译时首先小分子N两端的瞬时肽，它被瞬时肽识别细胞(SRP)所识别，SRP将细胞核可携带至上皮细胞上，上皮细胞管壁上的 SPR 受体识别并与之相结合。最初小分子细胞在瞬时肽引领下到达上皮细胞内腔，而瞬时肽则在瞬时磷酸酶的起着下被切除。由于它的引领，最初生的多肽就很难通过上皮细胞管壁进入腔内，最终被新陈代谢到胞外。在寄生物菌当中隐含小分子细胞时，比如说瞬时肽引领小分子细胞应在位新陈代谢到胞外，提高细胞矿物质，在原核隐含系统（大肠杆菌、细菌杆菌等）和原核隐含系统（如毕秃酵母菌）当中均有应用。
（6）.腺苷化亚基量化NetPhos []
KinasePhos-2.0 []
胺基酸腺苷化就是指由胺基酸激酶催化的把 ATP 的腺苷基移转到只不过物胺基酸核苷酸残基（酪氨酸、选择性、酪氨酸）上的全过程，或者在瞬时起着下相结合 GTP（通；也以 GTP 取代 GDP），是生物体内一种普通的调节形式，在细胞瞬时转导的全过程当中起极为重要起着。在瞬时大幅提高时通过获得一个或几个腺苷合资公司而被激活，而在瞬时弱化时能去除这些合资公司，从而得不到活性。有时某个瞬时细胞腺苷化通；也造成下游的细胞依次发生腺苷化，产生腺苷化并行反应。
二、基因组学软件及下载文档：
Clustal:
MEGA:
MAFFT:
Sequence Matrix:
PGDSpider:
DnaSP v6:
Arlequin:
MapMan：
PartitionFinder:
jModelTest:
IQ-TREE:
IQ-TREE离线:
RaxmlGUI:
Mrbayes 3.2.7:
PhyloSuite:
BEAST:
Figtree:
Tracer:
PopART:
Network:
Structure:
CLUMMP:
Distruct:
Migrate-N:
Phylonet: 或
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