献给初学者:常用的细胞凋亡侦测方法

2022-01-24 06:47:43 来源:
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在实验者里偶尔需要监测肝细六边形的突变情形,这里阐释了几种常见的突变监测原理,愿意很难帮到你。

一肝细六边形突变的型态学监测

频发突变的肝细六边形在型态上有一定的相似性。

光学光学和倒置光学

未漂白肝细六边形:突变肝细六边形的量缩小、变形,肝细六边形完备但用到PVC周期性,肝细六边形突变里后期可见突变肝细六边形。贴壁肝细六边形用到皱缩、变圆、脱落。

漂白肝细六边形:特指姬姆萨漂白、瑞氏漂白等。突变肝细六边形的漂白质果汁、强势,核子鞘降解、漂白质分割已成块螺旋状和突变肝细六边形等相比较的突变型态。

发光光学和共约借助于激光扫描光学

一般以肝体细六边形漂白质的型态学发生变本土化为这两项来评判肝细六边形突变的实质性情形。

特指的 DNA 特异性漂白有:HO 33342(Hoechst 33342),HO 33258(Hoechst 33258),DAPI。三种漂白与 DNA 的混合都是非微处理过程器的,主要混合在 DNA 的 A-T 序列区。紫外光激发时升空明亮的黄色发光。

Hoechst 是与 DNA 特异混合的能活性漂白,内含液体用氢氧本土化钠配已成 1 mg/ml 的酸度,运用于时用 PBS 盐酸,惟有酸度为 10 μg/ml。

DAPI 为半通透性,用于原则上固定肝细六边形的漂白。内含液体用氢氧本土化钠配已成 1 mg/ml 的酸度,运用于惟有酸度一般为 10 μg/ml。

结果评判

肝细六边形突变每一次里肝体细六边形漂白质的型态学发生变本土化分为三期:Ⅰ 期的肝体细六边形圆形波纹螺旋状(rippled)或圆形折缝样(creased),部份漂白质用到果汁螺旋状态;Ⅱa 期肝体细六边形的漂白质持续性汇聚、强势;Ⅱb 期的肝体细六边形降解为碎块,诱发突变肝细六边形(上图 1)。

透射电子光学推论

结果评判

突变肝细六边形量缩小,基质果汁。突变Ⅰ期(pro-apoptosis nuclei)的肝体细六边形内漂白质持续性直立,用到许多称为气穴周期性(citations)的空泡结构;Ⅱa 期肝体细六边形的漂白质持续性汇聚、强势;肝细六边形突变的里后期,肝体细六边形降解为碎块,诱发突变肝细六边形(上图 2)。

二Annexin V 国法

糖蛋白胺底物(Phosphatidylserine, PS)偶尔性位于肝细六边形的前端,但在肝细六边形突变的后期,PS 可从肝细六边形的前端翻转到肝细六边形的表面,暴露在肝细六边形外环境里(上图 3)。Annexin-V 是一种分子会值为 35~36 KD 的 Ca2+ 依赖性糖蛋白混合抗原,能与 PS 极低亲和力特异性混合。将 Annexin-V 完成发光素(FITC、PE)或 biotin 亦同上,以亦同上了的 Annexin-V 作为发光核酸,借助于流式肝细六边形祯或发光光学可监测肝细六边形突变的频发。

碘本土化丙啶(propidine iodide, PI)是一种核子酸漂白,它很难更再进一步完备的肝细六边形,但在突变里里后期的肝细六边形和临惟有时肝细六边形,PI 很难更再进一步肝细六边形而使肝体细六边形红染。因此将 Annexin-V 与 PI 归一本土化运用于,就可以将突变更早里后期的肝细六边形以及临惟有时肝细六边形区分开去。

原理

碎屑肝细六边形的漂白:将偶尔性培育出和诱导突变的碎屑肝细六边形(0.5~1×106)用 PBS 后下 2 次,投身 100 μl Binding Buffer 和 FITC 亦同上的 Annexin-V(20 μg/ml)10 μl,熔点避光 30 min,再投身 PI(50 μg/ml)5 μl,避光反应会 5 min 后,投身 400 μl Binding Buffer,第一时间用 FACScan 完成流式肝细六边形绝技定值监测(一般不最多 1 h), 同时以不加 AnnexinV-FITC 及 PI 的一管作为阴性比对。

贴壁培育出的肝细六边形漂白:先用 0.25% 的胰酵素消本土化,净本土化、漂白和数据分析同碎屑肝细六边形。

碰到片肝细六边形漂白:同上,最后用发光光学和共约借助于激光扫描光学完成推论。

结果

注意事项

1. 整个操作方法动作要尽值轻柔,不宜手掌吹打肝细六边形。

2. 操作方法时注意避光,反应会完毕后尽快在一星期内监测。

三肝细六边形内鞘动能的监测

肝细六边形内在肝细六边形突变的每一次里起着交汇点起到,多种肝细六边形突变刺激因子均可诱导并不相同的肝细六边形频发突变,而肝细六边形内一环动作电位(Δψm)的减小,被认为是肝细六边形突变小分子反应会每一次里最更早频发的惨剧,它频发在肝体细六边形突变相似性(漂白质果汁、DNA 撕裂)用到之前,一旦肝细六边形内一环动作电位崩溃,则肝细六边形突变随之而来。

肝细六边形内一环动作电位的实为定,使一些极性碱金属发光漂白如 Rhodamine 123、3,3-Dihexyloxacarbocyanine iodide(DiOC6)、Tetrechloro-tetraethylbenzimidazol carbocyanine iodide(JC-1)、Tetramethyl rhodamine methyl ester(TMRM)等可混合到肝细六边形内基质,其发光的减弱或消退说明肝细六边形内内鞘电负性的减小或减小。

原理

将偶尔性培育出的肝细六边形和诱导突变的肝细六边形投身运用于惟有酸度为 Rhodamine 123(1 mM)或惟有酸度为 DiOC6(25 nM),JC-1(1 mM),TMRM(100 nM),37 °C 连续性 30 min,流式肝细六边形收监测肝细六边形的发光其中心。

注意事项

1. 自始至惟有保持连续性染液体里 pH 值的一致性,因为 pH 值的变本土化将影响动作电位。

2. 与漂白降到连续性的肝细六边形悬液体里如果计有有抗原,他们将与部份漂白混合,减小漂白的酸度,引起实为去极本土化。

四DNA 影片本土化监测

肝细六边形突变时主要的克隆相似性是其漂白质频发果汁,漂白质 DNA 在核子肝细六边形单位之间的连接处撕裂,形已成 50~300 kbp 粗大的 DNA 大面积段,或 180~200 bp 整为数倍的寡核子苷酸影片,在黏性电泳上表现为四边形电泳上图谱(DNA ladder)。

肝细六边形经处理过程后,换用原则上原理受控提纯 DNA,完成琼脂糖黏性电泳和溴本土化乙啶漂白,在突变肝细六边形群里可推论到相比较的 DNA ladder。如果肝细六边形值甚少,还可在受控提纯 DNA 后,用 32P-ATP 和甘氨酸核子苷酸前端甘氨酸(TdT)亦同上 DNA,然后完成电泳和换射自扫描,推论突变肝细六边形里 DNA ladder 的形已成。

大分子会漂白体 DNA 影片的测定

肝细六边形突变的后期,漂白体撕裂已成为 50~300 kbp 粗大的 DNA 大面积段。所有最多一定分子会值大小的双链 DNA 分子会在琼脂糖黏性里的搬迁速度相同。线性 DNA 的螺旋形圆周最多黏性圆周时,即降到分辨力的连续性。此时黏性以后按分子会值的大小来筛分 DNA,DNA 像通过细管一样,以其底端指向动量一极而通过黏性,这种搬迁模式特指「碰到行」。因此,肝细六边形突变后期诱发的 50~300 kbp 粗大的 DNA 大面积段很难用普通的琼脂糖黏性电泳来受控。

通常换用极低频率电泳技绝技可此时此刻地应对这一问题。这个原理是在黏性上另加正交的交变极低频率动量。每当动量朝著发生变本土化后,大的 DNA 分子会就让滞留在碰到行胸腔,在此之后原先动量径向更再进一步定向后,才能继续向下移动。DNA 分子会值越大,这种重排所需要的短时间就越粗大。当 DNA 分子会变换朝著的短时间极小来将周期时,DNA 就可以按其分子会值大小分开。

DNA Ladder 测定

原理

赚得肝细六边形(1×107)沉淀→肝细六边形降解液体→13 000 rpm ×5 min→收集上清初,加 1% SDS 和 RnaseA(5 mg/ml)56 °C,圈养 2 h→抗原酵素 K(2.5 mg/ml)37 °C,2 h→1/10 量 3 mol/l 醋酸钠和 2.5 倍量的冷无水盐酸沉淀 DNA,4 °C 住处→14 000 rpm×15 min→最后将沉淀溶解在 TE buffer 里,加 DNA Loading Buffer→1.2% 琼脂糖黏性电泳,EB 漂白并摄影。

结果

突变肝细六边形 DNA 计有值的流式肝细六边形收数据分析

原理

收集肝细六边形→70% 冷盐酸(PBS 盐酸)4 °C 固定住处→PBS 净本土化,1 000 rpm × 10 min→RNase A(0.5 mg/ml)37 °C 消本土化 30 min→PI(50 mg/ml)漂白,熔点避光 15 min→FACScan 数据分析 DNA 亚二倍体的形已成及肝细六边形周期的变本土化。

结果

ApoAlertTM LM-PCR Ladder Assay

低成本:诱发极低,适合于监测少值抽样,小部份突变肝细六边形。如诊疗能活民间组织监测。

五TUNEL 国法

肝细六边形突变里,漂白体 DNA 双链撕裂或双螺旋撕裂而诱发大值的黏稠 3'-OH 前端,可在甘氨酸核子苷酸前端甘氨酸(TdT)的起到下,将甘氨酸核子苷酸和发光素、过氧本土化物酵素、碱性甘氨酸或生物素形已成的衍生物亦同上到 DNA 的 3'-前端,从而可完成突变肝细六边形的监测,这类原理称为甘氨酸核子苷酸前端甘氨酸诱导的孔洞前端亦同上国法(terminal -deoxynucleotidyl transferase mediated nick end labeling, TUNEL)。

由于偶尔性的或正在细六边形分裂的肝细六边形却是很难 DNA 的撕裂,因而很难 3'-OH 形已成,甚少很难被漂白。TUNEL 实际上是微生物学与型态学相混合的科学研究原理,对完备的单个突变肝体细六边形或突变肝细六边形完成特罗斯季亚涅齐漂白,能准确地反应会肝细六边形突变相比较的生物学和型态相似性,可用于石蜡包埋民间组织切片、冰冻民间组织切片、培育出的肝细六边形和从民间组织里受控的肝细六边形的肝细六边形型态测定,并可监测不止极少值的突变肝细六边形,因而在肝细六边形突变的科学研究里被普遍换用。

六Caspase-3 能活性的监测

Caspase 家族在诱导肝细六边形突变的每一次里起着非常极为重要的起到,其里 Caspase-3 为更为极为重要的执行分子会,它在突变信号表征的许多途径里体现机制。Caspase-3 偶尔性以酵素原(32 KD)的形式实为定于肠道里,在突变的后期阶段,它被激能活,能重置的 Caspase-3 由两个大蛋白(17 KD)和两个小蛋白(12 KD)组已成,降解相应的肠道六边形核子催本土化,事与愿违导致肝细六边形突变。但在肝细六边形突变的里后期和临惟有时亡肝细六边形,Caspase-3 的能活性引人注意减小。

Western blot

数据分析 Procaspase-3 的能重置,以及能重置的 Caspase-3 及对催本土化链螺旋状(ADP-核子糖)聚合酵素(PARP)等的降解。

原理

收集肝细六边形→PBS 净本土化→抽提肝细六边形降解液体→抗原定值→SDS-PAGE 电泳→纤维素鞘或 PVDF 鞘移往→5% 脱脂封闭,熔点 1.5~2 h 或 4 °C 住处→Caspase-3 多抗或肌肉注射熔点反应会 1~2 h 或 4 °C 住处→TBS-T(计有 0.05% Tween 20 的 TBS)后下 3 次,5~10 min/次→HRP-亦同上的鸡抗鼠 IgG 或 AP 亦同上的鸡抗鼠 IgG 熔点反应会 1~2 h→ TBS-T 后下 3 次, 5~10 min/次→ECL 扫描或 NBT/BCIP 盐类。

结果

发光分光镜光度收数据分析

能重置的 Caspase-3 很难特异接合 D1E2V3D4-X 催本土化,溶解 D4-X 氨基酸键。根据这一特点,另设收不止发光液体偶联的短氨基酸 Ac-DEVD-AMC。在共约价偶联时,AMC 很难被激发发光,短氨基酸被溶解后特赦不止 AMC,自由的 AMC 才能被激发升空发光。根据特赦的 AMC 发光其中心的大小,可以测定 Caspase-3 的能活性,从而解读 Caspase-3 被能重置的某种程度。

原理

赚得肝细六边形偶尔性或突变肝细六边形→PBS 净本土化→制备肝细六边形降解液体→加 Ac-DEVD-AMC(caspase-3 发光催本土化)→37 °C 反应会 1 h→发光分光镜光度收(Polarstar)数据分析发光其中心(激发窄带 380 nm,升空窄带为 430~460 nm)。

结果

流式肝细六边形绝技数据分析

原理

赚得肝细六边形偶尔性或突变肝细六边形→PBS 净本土化→加 Ac-DEVD-AMC→37 °C 反应会 1 h→UV 流式肝细六边形收数据分析 Caspase-3 阳性肝细六边形为数和平均值发光其中心。

结果

七TFAR19 抗原表述和肝细六边形整合数据分析

TFAR19(PDCD5)是由本科学研究组在国际上首先报导的一个拥有自己知识产权的人类新基因,前期的机制科学研究声称,它是有利于肝细六边形突变的减弱剂。借助于发光素(FITC)亦同上的 TFAR19 单克隆抗原为核酸,对肝细六边形突变每一次里 TFAR19 抗原的表述低水平及整合科学研究发现,突变后期 TFAR19 表述低水平减小并用到迅速核子二分周期性,伴随着肝体细六边形型态学的变本土化,停滞较粗大短时间,在突变肝细六边形里仍然可见。

同时我们发现,突变后期 TFAR19 抗原的核子二分更早于糖蛋白胺底物(PS)外翻和肝体细六边形 DNA 的影片本土化,定时 TFAR19 抗原的核子二分是肝细六边形突变更后期频发的惨剧之一。再进一步的科学研究证明,突变后期 TFAR19 的核子二分有着普遍意义,并不相同肝细六边形突变后期均用到 TFAR19 极低表述和核子二分。这为科学研究肝细六边形突变后期所频发的惨剧,提供了一种原先技绝技和这两项。

TFAR19 抗原的肝细六边形整合数据分析

材料还原剂

FITC 亦同上的单克隆抗原,pH 7.4 、0.15 mol/L PBS,3% 的链螺旋状甲醛,PBS-T(pH 7.4 、0.15 mol/L PBS 计有 0.2% Tween 20),胎牛小鼠,发光肝细六边形后下液体(pH 7.4 、0.15 mol/L PBS 计有 2% 胎牛小鼠及 0.1% NaN3),FACS 管,Tip 头,移液体器。

科学祯器

环境温度低水平超临界,37 °C 水浴箱,发光光学,共约借助于激光扫描光学,流式肝细六边形祯。

原理

1. 碎屑肝细六边形的漂白

(1)赚得偶尔性和诱导突变的肝细六边形(0.5~1×106),PBS 后下 2 次,1 000 rpm×10 min。

(2)3% 链螺旋状甲醛冰浴 10 min,PBS 后下 2 次,1 000 rpm×10 min。

(3)投身 PBS-T 溶液体,37 °C 圈养 15 min,PBS 后下 2 次,1 000 rpm×10 min。

(4)投身 200 ml 胎牛小鼠,熔点反应会 30 min。

(5)投身 5 ml FITC 亦同上的 TFAR19 肌肉注射(惟有酸度为 1:40),4 °C 反应会 30 min。

(6)发光肝细六边形后下液体后下 2 次,1 000 rpm×10 min。

将肝细六边形沉淀滴片,发光光学及共约借助于激光光学下推论 TFAR19 在肝细六边形里的整合。同时用流式肝细六边形祯定值监测 TFAR19 抗原的平均值发光其中心。

2. 贴壁肝细六边形的特罗斯季亚涅齐漂白

(1)贴壁生粗大的对为数期肝细六边形铺在 24 圆孔或 6 圆孔刷里(有数纯净盖玻片),让其碰到片生粗大,待粗大到 50%~80 % 满时,突变诱导剂处理过程肝细六边形。

(2)将并不相同短时间点处理过程的肝细六边形完成免疫发光漂白,漂白步骤同上。

(3)将漂白的碰到片肝细六边形换于一张滴有少值(5 ml)的载玻片上,发光光学或共约借助于激光扫描光学推论 TFAR19 在肝细六边形里的整合。

3. 诊疗病理切片的漂白、监测

4. 原代肝细六边形的培育出、监测

5. 数据分析 TFAR19 抗原在肺脏各民间组织器官的分布及整合

TFAR19 抗原的表述与诊疗疾病

ELISA 国法监测偶尔性人和疾病螺旋状态下,以及疾病的并不相同时期,小鼠里 TFAR19 抗原低水平及其 TFAR19 自身抗原低水平。

材料和还原剂

1. ;也 Buffer:pH 9.6, 0.05 mol/L 氯本土化钠 Buffer

2. 净本土化液体: pH 7.4,0.15 mol/L PBS 计有 0.05% Tween 20

3. 封闭液体: 3% BSA(用净本土化液体本土化学合成)

4. 酵素亦同抗原的盐酸:用封闭液体盐酸

5. OPD 催本土化 Buffer:Na2 HPO4·12 H2O 1.84 g,尿素 0.51 g,DDW 100 ml

6. 盐类液体(现配现用):催本土化 Buffer 10 ml,OPD 2 mg,30% H2O2 2 ml

7. 中止液体 2 mol/L H2SO4

8. 私营本土化人 TFAR19,HRP 亦同上的鸡抗人 IgG9 ELISA 刷,Tip,移液体器,ELISA Reader(OD 490 nm),后下刷机

操作方法步骤

1. 用;也 Buffer 盐酸的私营本土化人 TFAR19(1 mg/ml);也 ELISA 刷,100 ml/well,37 °C 圈养 2 h 或 4 °C 住处(一般 24 h 以上)。

2. 净本土化 Buffer 后下刷三次,投身封闭液体,200 ml/well , 37 °C 圈养 2 h 或 4 °C 住处。

3. 净本土化 Buffer 后下刷三次,投身并不相同盐酸度的病童小鼠(3 个以此类推圆孔)100 ml/well ,37 °C 圈养 1 h。另设;也 Buffer、净本土化 Buffer 、封闭液体为阴性比对。

4. 净本土化 Buffer 后下刷三次,投身 1:2 500 盐酸的 HRP 亦同上的抗人 IgG, 100 ml/well,37 °C 圈养 1 h。

5. 净本土化 Buffer 后下刷三次,投身盐类液体,100 ml/well,避光反应会 10~15 min。

6. 投身 H2SO4 中止反应会,50 ml/well。

7. ELISA Reader 加载 OD 490 光密度值,数据分析和相对病童小鼠和偶尔性血 清初里 TFAR19 自身抗原的表述低水平。

8. Western blot 数据分析上皮细六边形肝细六边形和偶尔性肝细六边形的 TFAR 19 抗原的表述低水平。

引文

Brown,D.G., Sun, X.M., and Cohen, G.M.(1993) Dexamethasone-induced apoptosis involves cleage of DNA to large fragments prior to internucleosomal fragmentation. J. Biol.Chem. 268, 3037-3039

Herrmannm M, Lorenz HM, Voll R et al. A Rapid and simple method for the isolation of apoptotic DNA fragments. Nucleic Acid Res. 1994; 22:5506-5507

文章来源:丁香园站友 midas

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编辑: 任悠悠

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